《沉默》是远藤周作早年的重要作品，它是根据十七世纪的日本史料创作的历史小说，故事背景发生在德川幕府下达禁教令的时代，葡萄牙的耶稣会教士洛特-加龙省里哥受命到长崎，调查他的恩师费雷拉神父（Ferreira）当年弃教的原因。洛特-加龙省里哥在传教与寻访过程中，经历种种现实的冲突与挣扎，体会到人性的软弱，对基督信仰进行更深层的思考。

与基督教世界推广的其他电影相比，《沉默》这部电影中的对话包含了更多基督教教义，深刻地反思神的恩典与人的弃教、相信与背叛的沉重议题，观众可能不容易理解片中欲传达的理念：费雷拉神父面对德川幕府的禁教令，如果不宣布弃教，幕府就会多杀一个信徒，那么，神父到底要选择神而殉教？还是选择人以挽救其他无辜信徒？在这样的两难中，神父选择踩踏象征信仰的耶稣圣像，因着软弱体恤生命而口里拒绝了信仰。

就像其他伟大的电影一样，《沉默》一片可用许多不同的方式解读，它也让人联想到影史上其他经典，像是弗朗西斯‧柯波拉（Francis Ford Coppola）根据波兰裔英国作家约瑟夫．康拉德（Joseph Conrad）的小说《黑暗之心》（The Heart of Darkness）改编的电影《现代启示录》（Apocalypse Now），以及约翰．福特（John Ford）执导的《搜索者》（The Searchers）。

这两部电影都传达出类似的主题，就是原本奉命消灭邪恶力量的英雄，在旅程中因为受到恐惧、暴力、仇恨的摧残，最后渐渐变成自己本来想要消灭的魔王。在《沉默》这部电影中，观众看到的也是一趟旅程，它不只是揭露了拒绝基督信仰光照的黑暗世界，也揭露了信徒心中对信仰产生怀疑和恐惧的黑暗面。

纽约评论家理查德．布拉迪（Richard Brady）认为，史科西斯在《沉默》片中再次运用了同样的主题：现今的世代也是一样，继续在寻找救赎，他们不想被拯救。

《沉默》这部电影一开始，观众发现残忍的审判者并不是基督教或伊斯兰教，而是信仰佛教的当权者时，可能因为基督宗教被逼迫、信徒受苦而感动。但不久之后，观众就会开始疑惑：如果一定要公开践踏耶稣圣像，也就是透过所谓的“踏绘”仪式宣示弃教，才能救其他信徒不受凌虐杀害的话，到底这些宗教象征有那么重要吗？践踏这些信仰象征有那么严重吗？电影中最发人省思的对话之一，就是有教士说，那些受逼迫的信徒“把信仰的象征看得比信仰本身还重要”。

为了理解这个问题，我们需要认识，在罗马天主教是由圣餐（圣体圣事）所主导，主理圣餐成为天主教与基督新教争论的焦点之一，因为天主教相信信徒在圣餐中领受的无酵饼和葡萄酒，在神父祝圣时即化成基督的身体和宝血（“变体”），但基督新教一般不认同此观点。当然，基督宗教信仰的根基建立在道成肉身上，但对于犹太教、伊斯兰教和其他东方宗教来说，都没有这样的教义。

洛特-加龙省里哥在传教与寻访过程，经历种种现实的冲突与挣扎。

身为天主教徒的远藤周作看自己的信仰“更接近基督新教”，认为信仰是他自己与上帝之间的事，只能用恩典解释。不过，塞哥维亚牧师认为，《沉默》这本书要表达的，并不只是远藤周作具有个人特色的信仰以及至高无上的恩典，还有他怀疑信仰象征的价值，有没有必要超过信仰本身这个议题。

日本名画家藤村真（Makoto Fujimura）可以帮助人们更多理解远藤周作的信仰。藤村真透过英文创作，在美国出版了好几本书，在其中一本他献给远藤周作的书中，还找了美国基督教作家杨腓力（Philip Yancey）写序。

塞哥维亚牧师指出，《沉默》这个故事的确是建立在天主教的根基上，其中所探讨的“弃教”主题也被拿来与基督的牺牲相比。这个主题并不罕见，其观点源自1970年代的神学，认为教会遭逼迫要归因于差派到国外的宣教士。此外，《沉默》这本书也让人想起“匿名基督徒”这个主题，它类似伊斯兰教中的“浸礼宣道学”或是预测教会将会消失的世俗神学，不过塞哥维亚并不认为这是远藤周作想要在《沉默》书中探讨的议题。

塞哥维亚牧师设法体会远藤周作的处境，指出信仰天主教的远藤周作，在神道教与佛教为主的日本社会中属于少数，而信仰基督新教的塞哥维亚，在天主教为大的西班牙，同样属于比例低于总人口百分之一的少数。塞哥维亚提到《沉默》一再出现的句子之一，是审判者说，基督宗教没有在日本落地生根并不是宣教士的错，而是这个沉沦的世界所造成的。

塞哥维亚牧师认为，现今基督宗教在西方世界面临的处境，与十七世纪天主教在日本并没有太大的不同。虽然今天的教会并不是受逼迫的少数，但现今教会所提倡的道德观并不受世俗社会认可，也不知如何处理像是教会在欧洲日益边缘化和受藐视的问题。

塞哥维亚牧师表示，远藤周作说，上帝在受苦中对世界说话。腓立比书二章7-8节说，耶稣“反倒虚己，取了奴仆的形像，成为人的样式，既有人的样子，就自己卑微，存心顺服，以至于死，且死在十字架上。”上帝来到这个世界，在软弱中显现祂的力量。保罗在哥林多后书十二章10节说：“因我什么时候软弱，什么时候就刚强了。”

塞哥维亚认为，在基督教教义上，《沉默》这部电影比其他教导“重要价值”的电影更重要，因为它不只是简单推论“上帝未死”，而是从电影中导出上帝在软弱、怀疑、受苦当中，与世人同在的事实。

痛苦并不能使我们与上帝隔绝，反倒是让我们更接近祂，跟随耶稣是一趟充满软弱、苦楚与爱的旅程。

我们当然不想要因为信仰受逼迫，但逼迫可能无法避免。面对信仰的逼迫，以赛亚书五十三章7节说：“他被欺压，在受苦的时候却不开口。”基督徒可能无法拯救世界，因为即使我们再怎么努力效法基督，还是只有基督能够拯救世界。如同《沉默》这部作品提醒我们的，我们就像彼得或犹大一样，需要上帝的救赎，而这样的救赎，只有透过祂的恩典才能得着。