伊斯兰教开始大量输出恐怖份子，是伊斯兰教自近代以来逐步走向原教旨化和极端化的结果，也是近代世界发展的副产品。
所以要知道这个问题的答案，需要从历史和政治两个方面入手：从历史的角度看伊斯兰教的特殊性，以及从政治角度看伊斯兰教为什么会走向原教旨化
众所周知，世界三大宗教中，佛教在公元前已经出现，基督教在一世纪出现，而伊斯兰教是公元六世纪才正式出现。
穆斯林民族，不仅具有民族属性，同时具有“准政治组织”的特性，在社会生活中，天然就比其他民族多一层组织架构：穆斯林有自己的党纲——古兰经，有自己的党支部——清真寺；有自己的政委——阿訇；有自己的党规——伊斯兰教法；有自己的最高理想和共同理想——为主道而奋斗，向全世界传播信仰；有自己的政治生活——阿訇宣讲、信徒礼拜，一生中必须回总部受训一次，受训后在本组织中的地位和荣耀得到提升。
此外，穆斯林也有自己的整风运动——无论贫富和地位，每年禁食一个月，期间停止娱乐和战争；有自己的税收体系——天课；有自己的民政系统——清真寺会接济穷困穆斯林，介绍婚姻等；有自己的政治敌人——不信主道的卡费勒；有政治生态中常见的派系区分——极端派和温和派（可类比左派和右派）；有秉持相同理念的强大外援——沙特等穆斯林国家，以及其他伊斯兰组织。
甚至有当今最时髦的普世价值——只要信教，不问来历，不问出身，不问肤色，人人平等。比起其他宗教，伊斯兰教提供的是涵盖生活方方面面的指导和标准，包括且不仅限于：
1、成文法，也即是初级的法律条文
2、社会组织架构，也即是社会应当是什么样的结构、社区的规模、组织的层级、上下的等级以及责任/义务
3、生活方式的规则，也即是如何组织生产、进行社会生活与政治生活
4、文化系统，也即是诗歌、文学等方面的基本指导，以及精神方面的服务
5、如何进行军事组织与训练，并且提供了区分敌/我的简单方法
伊斯兰教就好象苹果OS系统一样，虽然完全封闭，但是简单易用，傻瓜式操作，只要一本《可兰经》在手，哪怕是只剩下几个传教士，也可以在非常短的时间内把任何（以当时的标准来说）处于低文明程度的社会群落（例如各种游牧民族）瞬间拉升到非常先进的水平，建立起完整的政治、军事、经济与文化社会体系。
从这一点来讲，这也是为什么伊斯兰教可以迅速传播，后来居上稳坐三大宗教之一的位置，并且在无数文明程度较低的社会群落里蔓延开来的原因。
关于阿拉伯世界以及世界上其他伊斯兰教地区的普遍极端化和原教旨主义的抬头，上面的很多答案已经讲得非常详细了，在此也就不多做复述，主要从一个方向性的角度来讲一下一己之见：
近代世界进入了殖民主义，又走出了殖民主义，进入了民族主义，又慢慢走出了民族主义（或者说正在寻找新的替代解释，例如多元文化主义，再此不多说），世界秩序经历了不止一次的“建立—崩解—再建立”的过程，但是伊斯兰教由于其闭源的特性，其稳定性从优点变成了缺点，导致其并不能适应于目前的世界整体架构。
进一步来说，当一战前英国核心的殖民主义秩序建立起来时，伊斯兰世界被动进入那个时代，自然资源的限制决定了他们无法像英国或欧洲其他地区的国家那样进入工业化生产，所以仍然维持了原有的生产方式和社会结构，哪怕他们已经把武器换成了委员会步枪或者李恩菲尔德，王公贵族的坐骑也换成了劳斯莱斯，但是其社会结构仍然是“基本不变”的，等到二战结束，全球殖民体系被美苏联手肢解，世界各地（包括阿拉伯地区）纷纷以威尔逊很早之前就提出的民族自决原则，在主要由美国推动的世界秩序重构过程中变成了一个个的新“国家”时，伊斯兰社会仍然是被动进入我们目前仍生活着的这个时代的，一个闭源系统被强行塞进了另外一个开源系统里面，大家的代码在同一个架构里面一起运行的时候，会发生什么？当然是BUG。
我还记得看HBO的《杀戮一代》时，里面有一个镜头：B连和一群其他阿拉伯国家跑到伊拉克打仗的大学生志愿者作战之后，打扫战场时发现其中一个战死的叙利亚大学生护照上，入境原因写的是“讨伐异教徒”——对于伊斯兰教世界来说，现有社会秩序之下的国籍、国家等等概念其实都没什么意义，他们在精神上仍然是一个整体，国境线可以把欧洲人和亚洲人分隔开来，但是对于伊斯兰教社会来说，国境线只是一个在他们的社会里没什么认同感的东西。
因此，二战结束之后，原教旨主义在伊斯兰世界迅速传播，其核心思路很简单：我们把自己的代码塞进他们的系统里面根本跑不动，所以还是闭源大法好，不跟他们玩了！
佛教、基督教没有这样的问题，是因为他们的适应性更好，或者说，主流教义里面并没有过多的详细规定，且在千年的传播过程中，把大部分过于敏感会影响整体运行的语句自行排除掉了。
更进一步的说，那一整套包括政治、经济、文化生活和社会结构的伊斯兰教教义，正是其完整性的一部分，所谓牵一发而动全身，几乎不可能通过去掉一部分（旧的生活模式）的方式来适应新的世界运作体系，勉强算是成功的也就土耳其和伊朗两个例子，更多的则是像曾经影响巨大的伊斯兰复兴党建立起的国家一样，要么再保守化（伊拉克），要么内乱丛生（叙利亚、埃及）。
总的来讲，占据了伊斯兰世界政治、思想控制权的统治阶级，如沙特的油王们，虽然看似现代化，买豪华客机开跑车去美国看病修建高楼大厦享受现代生活，但是如果要让整个伊斯兰世界废除很多已经过时落后不合时宜的条条框框，打开伊斯兰世界的封装外壳，让其成为现代社会程序中的一部分，对于他们来讲是无法接受的，所以说，伊斯兰教的问题不是曲解，而是根本不给解。
对于伊斯兰世界的政治、宗教领袖来说，伊斯兰教社会的旧结构无法适应新的世界，并且频频发生冲突报错时，要么变动旧结构，要么干脆否认这个世界的二元选项里面，他们只能选后面那个，因为他们的诸多权利都来源于伊斯兰世界的保守架构，而伊斯兰教其结构上极难更改的特性决定了，任何对其社会结构的更改都等于对其宗教神圣性的否定，也就等于在政治上判处自己死刑，不管是出于什么样的因素，他们都必须要保持伊斯兰教旧有结构的完整，这是保证他们权利延续的唯一方法。
而一个拥有完整社会结构，可以不依靠主流文化群体自行完成社会生活与组织的文化群体走向原教旨主义时，如果人数相对来说处于绝对少数，如阿米什人，他们只能把自己封闭起来，拒绝接受现有世界的社会身份；但是如果这个群体的人数并不是绝对少数，并且拥有与主流文化抗衡的实力时，事情往往会变得很血腥。
进一步讲，任何一个伊斯兰社会走出，信奉伊斯兰教的人，同时都拥有两个社会身份：其目前社会的社会身份（国籍），其伊斯兰社会的身份（伊斯兰教信仰建立起来的是一整套社会，任何信众在此之中都有一个位置，不妨看作精神国籍），两个身份都在向这个人输入文化认同，而如今，世界的主流文化中并不存在压倒性的强势文化，故此走向原教旨的伊斯兰教，在沙特油王们的大把美金赞助之下在精神领域攻城略地，在伊斯兰教信众之中逐步占据了绝对主流的地位，而当这国籍与信仰两个身份发生认同冲突难以共存时，演变成暴力冲突就只是一个时间问题了。
当我们通过历史和政治的角度，分析伊斯兰教为什么大量输出恐怖分子时，并不是站在道德制高点去批判，而更应该直面自己内心的状况。现实告诉我们，倘若我们的心没有得到改变，罪案只是罪性的形成结果。几百年前，被誉为英国讲道王子的司布真，曾对英国的民众发出了下面这些掷地有声的声音。
若不是出于恩典，你现在会身处何方？重复约翰▪百福德那句老话，当时他看到一车人被拉往泰伯恩行刑场接受绞刑：“要不是神的恩典，约翰▪百福德也要去了。”当你看到街上咒骂的人，或在夜间摇摇晃晃回家的醉汉，要不是出于神的恩典，你会是那样，我会是那样。
我是谁？如果主不施怜悯，拦阻我疯狂的行径，我本会落入何等光景？我知道我们一些人记得罗兰·希尔的老故事，当时一位苏格兰好人请求见他，此人一言不发，五分多钟坐着一动不动，盯着这位老好人绅士的脸。最后罗兰·希尔问他，是什么让他如此专注。他说：“我在看你脸上的皱纹。”“嗯，你从它们看到什么？”他说：“嗨，如果神的恩典不在你身上，你就会变成活生生最大的恶棍。”
我们一些人有同样感受，要不是神的恩典，我们就会成为各种各样丑行和罪恶彻头彻尾的罪魁祸首。我知道我自己绝不能做事三心二意。我若服事巴力，就会为牠建一座祭坛，在坛上献祭，白天黑夜烟火上腾；如果我们热心恒切服事神，我们就有更多理由谦卑，屈身俯伏在尘土当中；因为除非神的恩典乐意改变我们，就连这灵里火热也会派上最恶劣的用场。
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